要提升万方个人查重系统的查重效率，首先可以考虑优化系统设置。通过调整查重参数、增加查重深度、优化查重模式等方式，可以提高系统的查重速度和准确性。此外，还可以针对不同类型的文档，设置不同的查重规则，以提高系统的适用性和效率。另外，定期更新系统版本，修复bug和优化算法也是提升查重效率的重要手段。

其次，提高算法精度也是提升万方个人查重系统查重效率的关键。优化查重算法，提高查重的准确性和速度，可以有效提升系统的查重效率。可以引入新的查重算法，结合机器学习和人工智能技术，提高系统的智能化水平，进一步提升查重效率。此外，还可以优化系统的数据处理能力，提高系统的并发处理能力，以应对大规模文档的查重需求，提高系统的处理效率。